生殖器疱疹需要和如下疾病相互鉴别：一、毛囊炎。一般毛囊炎表现为生殖器皮肤上面有丘疹，如果毛囊炎成熟，则在丘疹里还会有脓头。生殖器疱疹一般是丘疹里面含有液体。二、生殖器疱疹需要以硬下疳相互鉴别。硬下疳主要表现为局限性，无痛性的溃疡，没有明显的水泡，与生殖器疱疹是有不同的。