重症手足口病主要是合并的有神经系统的症状，而且会有神经源性肺水肿，心脏的病变情况。所以确诊手足口病除了要进行病原学的检查，比方EV71病原体的检查，还需要做神经系统的检查。心脏的检查以及肺功能这些检查。但是这些症状往往发生得比较迅速，所以重症手足口病也主要靠临床的症状来进一步的确诊和诊断。