治疗扁平疣的药膏有很多，常见的有五氟尿嘧啶乳膏、咪喹莫特乳膏、五妙水仙膏、干扰素乳膏或者喷雾剂、维a酸乳膏等。除了这些药膏以外，还可以外用酞丁安搽剂。扁平疣比较容易复发，反复发作者可以口服免疫调节药物，如匹多莫德。尽量不要用手搔抓，以免疣体传到其他部位。