碎结石对肾脏的损害是否大，取决于手术的方式。一般碎结石包括体外碎石术以及输尿管镜碎石术和经皮肾镜碎石术。体外碎石术对肾脏的损害一般不大，部分患者在手术后有可能出现肾脏血肿，一般过一段时间会自行消失。输尿管镜碎石术对肾脏的损害不大，因为大多数输尿管镜碎石术不会触及到肾脏。而经皮肾镜碎石术对肾脏的损害相对较大，因为手术需要在肾脏里面打一个造瘘口，引起肾脏出血，还会在肾脏留有疤痕。