肛门总有便意的最常见疾病是直肠发炎或者肛窦发炎、肛乳头发炎等，还考虑存在直肠粘膜下脓肿或者肛周脓肿等感染化脓性疾病，患者还需排查是否存在痔疮。痔疮当中的内痔反复脱出或者外痔部分有充血、水肿、血栓形成，易产生肛门有便意的情况；需及时检查，及早进行对因、对症的治疗。